Nhận diện và đánh giá các gene trung tâm (hub genes) và mạng lưới đồng điều hòa miRNA liên quan đến sự xâm nhiễm miễn dịch và tương tác thuốc trong lao tiềm ẩn dựa trên phân tích dữ liệu Microarray, docking phân tử và mô phỏng động lực học
Bệnh lao (TB) vẫn là một vấn đề sức khỏe toàn cầu nghiêm trọng, trong đó quá trình chuyển đổi từ lao tiềm ẩn sang lao hoạt động vẫn chưa được hiểu rõ. Do đó, việc tăng cường quản lý lâm sàng và các chiến lược phòng ngừa lao là vô cùng thiết yếu. Dữ liệu giải trình tự hiệu năng cao của các gene và miRNA từ những cá thể ở các giai đoạn lao khác nhau đã được thu thập từ NCBI. Phân tích biểu hiện gene sai biệt được thực hiện bằng gói phần mềm limma trong ngôn ngữ R, cùng với các phân tích GO (Linh hoạt hóa chức năng gene) và KEGG (Phân tích con đường chuyển hóa).

Mạng lưới điều hòa trung tâm của các miRNA được trực quan hóa bằng Cytoscape, và các gene liên quan được thẩm định thông qua phân tích biểu đồ ROC. Các gene then chốt dự đoán có liên quan đến sự chuyển đổi từ lao tiềm ẩn sang lao hoạt động, bao gồm PLEKHG1, CLPB, DOK4, IL1β, và TLR3, chủ yếu liên quan đến các quá trình sinh học của sinh vật đa bào, phản ứng với kích thích, sự gắn kết phối tử GPCR và các chức năng miễn dịch.

Cuối cùng, chúng tôi đã sàng lọc được Celastrol và Cefaclor Anhydrous hướng đích IL1β như những ứng viên thuốc kháng viêm tiềm năng nhằm giảm thiểu tình trạng viêm nhiễm do lao. Những phát hiện này đã được thẩm định thêm bằng mô phỏng động lực học phân tử, phương pháp MM-GBSA và phân tích thành phần chính (PCA). Nghiên cứu của chúng tôi thúc đẩy sự hiểu biết về lao tiềm ẩn, đồng thời xác định các gene và microRNA là các dấu ấn sinh học (biomarkers) tiềm năng cho việc chẩn đoán, theo dõi và điều trị, mang lại ý nghĩa sâu rộng cho các nghiên cứu về những bệnh lý phức tạp.

Người viết bài: TS. Đinh Phong Sơn
Người duyệt bài: TS. Đinh Phong Sơn
Người đăng bài: CN. Nguyễn Đình Minh Quân